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Functional classification of Candida albicans hits

Contact:
Birgit Eisenhaber (IMP/Austria)
Georg Schneider (IMP/Austria)
Michael Wildpaner (IMP/Austria)
Frank Eisenhaber (IMP/Austria)

Summary Table:

Protein Families Number of Proteins with predicted N-terminal Signal Peptide Number of Proteins without predicted N-terminal Signal Peptide
Agglutinin-like 5 3
Other Cell Wall Proteins 34 3
Copper/zinc superoxide dismutases (SODC) 4 -
Extensin related 2 -
Flocculins 2 -
GAS1 6 -
Lysophospholipases 3 2
Peptidases 4 2
Seripauperin and TIP1 family 2 -
SPS2-like 2 -
Sugar Hydrolases 13 -
Transporters - 8
Other Functions 2 12
Hypothetical Proteins/Unknown Function 90 35

Agglutinin-like

orf19.5736.prot orf10233:63367-67410:e 4044 bp, 1347 aa (ALA1_CANAL)
orf19.5741.prot orf10233:72223-76005:e 3783 bp, 1260 aa (ALS1_CANAL)
orf19.7414.prot orf2514:42108-46208:e 4101 bp, 1366 aa (agglutinin-like protein 6)
orf19.13158.prot orf20233:62616-66659:e 4044 bp, 1347 aa (ALA1_CANAL)
orf19.13163.prot orf20233:71475-75257:e 3783 bp, 1260 aa (ALS1_CANAL)
without predicted N-terminal signal peptide
orf19.2122.prot orf10140:3344-3820:e 477 bp, 158 aa
orf19.4556.prot orf2201:12002-13615:e 1614 bp, 537 aa
orf19.9670.prot orf20140:3344-3820:e 477 bp, 158 aa

Other Cell Wall Proteins

CW12_YEAST (Q12127) homologues
orf19.4765.prot orf10215:93172-92513:e 660 bp, 219 aa 
orf19.12229.prot orf20215:92299-91640:e 660 bp, 219 aa
CW14_YEAST (Q13547) homologues
orf19.7030.prot orf10262:72194-71490:e 705 bp, 234 aa
DAN4_YEAST (P47179) homologues
without predicted N-terminal signal peptide
orf19.5401.prot orf10227:62961-60892:e 2070 bp, 689 aa
orf19.12856.prot orf20227:62949-60880:e 2070 bp, 689 aa
HWP1_CANAL (P46593, O13424, P87019) homologues
orf19.1321.prot orf10109:46155-44251:e 1905 bp, 634 aa
orf19.1327.prot orf10109:61661-63805:e 2145 bp, 714 aa
orf19.3380.prot orf10174:38859-36133:e 2727 bp, 908 aa
orf19.3384.prot orf10174:43959-42856:iN 1104 bp, 367 aa
orf19.8901.prot orf20109:46143-44239:e 1905 bp, 634 aa
orf19.8907.prot orf20109:61643-63787:e 2145 bp, 714 aa
orf19.10273.prot orf20158:192046-193599:e 1554 bp, 517 aa
orf19.10888.prot orf20174:38874-36148:e 2727 bp, 908 aa
orf19.10892.prot orf20174:43964-42861:iN 1104 bp, 367 aa
HYR1_CANAL (P46591) homologues
orf19.465.prot orf10053:1715-4540:e 2826 bp, 941 aa
orf19.575.prot orf10057:12905-16654:e 3750 bp, 1249 aa
orf19.2879.prot orf10162:22599-26525:e 3927 bp, 1308 aa
orf19.4072.prot orf10196:16011-12751:e 3261 bp, 1086 aa
orf19.4361.prot orf10203:24842-27667:e 2826 bp, 941 aa
orf19.4975.prot orf10216:152086-154845:e 2760 bp, 919 aa
orf19.7472.prot orf2516:22398-17818:e 4581 bp, 1526 aa
orf19.8096.prot orf20053:1715-4540:e 2826 bp, 941 aa
orf19.8206.prot orf20057:12902-16651:e 3750 bp, 1249 aa
orf19.10397.prot orf20162:22602-26537:e 3936 bp, 1311 aa
orf19.11553.prot orf20196:14660-11397:e 3264 bp, 1087 aa
orf19.11839.prot orf20203:24806-27631:e 2826 bp, 941 aa
orf19.12440.prot orf20216:152490-155303:e 2814 bp, 937 aa 
orf19.3279.prot orf10172:140669-144346:e 3678 bp, 1225 aa (S>0)
orf19.10789.prot orf20172:140637-144314:e 3678 bp, 1225 aa (S>0)
without predicted N-terminal signal peptide
orf19.5124.prot orf10219:1429-2847:en 1419 bp, 472 aa
WAP1 [Candida albicans] (AAG09792, GI:9963992) homologues
orf19.5635.prot orf10231:4566-5225:e 660 bp, 219 aa (DUF721, pfam05258 Protein of unknown function)
orf19.5636.prot orf10231:6478-7203:e 726 bp, 241 aa
orf19.5674.prot orf10231:60312-59560:e 753 bp, 250 aa 
orf19.13080.prot orf20231:4566-5225:e 660 bp, 219 aa
orf19.13081.prot orf20231:6478-7203:e 726 bp, 241 aa
orf19.13119.prot orf20231:60316-59564:e 753 bp, 250 aa 
orf19.7114.prot orf10262:230994-234050:e 3057 bp, 1018 aa

Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) (PF00080, sodcu)

orf19.2060.prot orf10139:124618-125304:e 687 bp, 228 aa
orf19.2062.prot orf10139:127254-127952:e 699 bp, 232 aa
orf19.9607.prot orf20139:124373-125059:e 687 bp, 228 aa
orf19.9609.prot orf20139:127009-127707:e 699 bp, 232 aa

Extensin_2 (PF04554, Extensin-like region)

orf19.2355.prot orf10147:2941-7701:e 4761 bp, 1586 aa
orf19.9891.prot orf20147:2941-7707:e 4767 bp, 1588 aa

Flocculins

orf19.3618.prot orf10184:50017-48416:e 1602 bp, 533 aa 
orf19.11101.prot orf20184:50146-48545:e 1602 bp, 533 aa

GAS1 (PF03198, Glycolipid anchored surface protein (GAS1))

orf19.3829.prot orf10192:117957-119603:e 1647 bp, 548 aa
orf19.4035.prot orf10194:249890-248535:e 1356 bp, 451 aa
orf19.6081.prot orf10237:161755-160121:e 1635 bp, 544 aa
orf19.11310.prot orf20192:117993-119639:e 1647 bp, 548 aa
orf19.11518.prot orf20194:252756-251401:e 1356 bp, 451 aa
orf19.13500.prot orf20237:157779-156145:e 1635 bp, 544 aa

Lysophospholipases (PLA2_B, PF01735)

orf19.5102.prot orf10218:108302-106038:e 2265 bp, 754 aa
orf19.6594.prot orf2449:8622-10520:e 1899 bp, 632 aa
orf19.12568.prot orf20218:108241-105977:e 2265 bp, 754 aa
without predicted N-terminal signal peptide
orf19.1443.prot orf10119:5366-6280:e 915 bp, 304 aa
orf19.9018.prot orf20119:5367-6281:e 915 bp, 304 aa

Peptidases

Eukaryotic aspartyl protease (PF00026)
orf19.3839.prot orf10192:129205-127844:e 1362 bp, 453 aa
orf19.6928.prot orf10259:16134-17768:e 1635 bp, 544 aa
orf19.11320.prot orf20192:129241-127880:e 1362 bp, 453 aa
orf19.14190.prot orf20259:16133-17767:e 1635 bp, 544 aa
Rhomboid family (PF01694)
without predicted N-terminal signal peptide
orf19.5234.prot orf10223:36321-38330:e 2010 bp, 669 aa (S>0)
orf19.12698.prot orf20223:36283-38292:e 2010 bp, 669 aa (S>0)

Seripauperin and TIP1 family (PF00660, SRP1_TIP1)

orf19.532.prot orf10053:117460-116954:e 507 bp, 168 aa
orf19.8165.prot orf20053:117529-117023:e 507 bp, 168 aa

SPS2-like

orf19.4255.prot orf10202:69399-68158:e 1242 bp, 413 aa
orf19.11730.prot orf20202:69075-67834:e 1242 bp, 413 aa

Sugar Hydrolases

glycosyl hydrolases (families 5 (cellulase), 16, 18, 76; PF00150, PF00722, PF00704, PF03663)
orf19.2952.prot orf10163:55095-53656:e 1440 bp, 479 aa ; cellulase
orf19.10469.prot orf20163:54744-53305:e 1440 bp, 479 aa ; cellulase
orf19.2237.prot orf10143:14263-15840:e 1578 bp, 525 aa (S>0) ; cellulase
orf19.9779.prot orf20143:14288-15865:e 1578 bp, 525 aa (S>0) ; cellulase
orf19.1671.prot orf10123:148333-149745:e 1413 bp, 470 aa ; Glyco_hydro_16
orf19.2706.prot orf10158:92919-94280:e 1362 bp, 453 aa ; Glyco_hydro_16
orf19.3966.prot orf10194:121747-123261:e 1515 bp, 504 aa ; Glyco_hydro_16
orf19.9240.prot orf20123:148155-149567:e 1413 bp, 470 aa ; Glyco_hydro_16
orf19.10221.prot orf20158:86016-87377:e 1362 bp, 453 aa ; Glyco_hydro_16
orf19.11448.prot orf20194:121844-123358:e 1515 bp, 504 aa ; Glyco_hydro_16
orf19.3895.prot orf10194:4127-2376:e 1752 bp, 583 aa ; Glyco_hydro_18
orf19.2075.prot orf10139:153793-152438:e 1356 bp, 451 aa ; Glyco_hydro_76
orf19.9622.prot orf20139:153548-152193:e 1356 bp, 451 aa ; Glyco_hydro_76

Transportes

without predicted N-terminal signal peptide
orf19.2069.prot orf10139:142527-144071:e 1545 bp, 514 aa; Nramp (PF01566, transport of divalent cations)
orf19.9616.prot orf20139:142282-143826:e 1545 bp, 514 aa; Nramp (PF01566, transport of divalent cations)
orf19.4174.prot orf10200:33689-32328:e 1362 bp, 453 aa (PF01733, Nucleoside transporter)
orf19.11650.prot orf20200:33884-32523:e 1362 bp, 453 aa (PF01733, Nucleoside transporter) 
orf19.1424.prot orf10115:33760-32045:e 1716 bp, 571 aa; sugar_tr (PF00083, Sugar (and other) transporter)
orf19.6578.prot orf10248:239508-237865:e 1644 bp, 547 aa; sugar_tr (PF00083, Sugar (and other) transporter)
orf19.9000.prot orf20115:33760-32045:e 1716 bp, 571 aa; sugar_tr (PF00083, Sugar (and other) transporter)
orf19.13931.prot orf20248:232059-230416:e 1644 bp, 547 aa; sugar_tr (PF00083, Sugar (and other) transporter)

Other Functions

orf19.3212.prot orf10171:11084-9408:e 1677 bp, 558 aa (calcium channel MID1)
orf19.10724.prot orf20171:11393-9714:e 1680 bp, 559 aa (calcium channel MID1)
without predicted N-terminal signal peptide
orf19.5265.prot orf10223:89584-92298:e 2715 bp, 904 aa (S>0); kinesin (N-terminal domain, PF00225, Kinesin motor domain)
orf19.12730.prot orf20223:89586-92300:e 2715 bp, 904 aa (S>0); kinesin (N-terminal domain, PF00225, Kinesin motor domain)
orf19.1212.prot orf10101:4436-3201:e 1236 bp, 411 aa; MSP domain (PF00635, Major sperm protein)
orf19.8800.prot orf20101:4356-3247:e 1110 bp, 369 aa; MSP domain (PF00635, Major sperm protein)
orf19.3344.prot orf10173:111516-113075:e 1560 bp, 519 aa (PF00787, PX domain, binds to phosphoinositides)
orf19.10852.prot orf20173:111782-113341:e 1560 bp, 519 aa (PF00787, PX domain, binds to phosphoinositides) 
orf19.2411.prot orf10148:50890-51690:e 801 bp, 266 aa (syntaxin)
orf19.4292.prot orf10202:139322-140152:e 831 bp, 276 aa (syntaxin)
orf19.9949.prot orf20148:50901-51701:e 801 bp, 266 aa (syntaxin)
orf19.11768.prot orf20202:140008-140838:e 831 bp, 276 aa (syntaxin)
orf19.6756.prot orf10254:77573-76680:e 894 bp, 297 aa (S>0); Yip1 (PF04893, Yip1 domain)
orf19.14048.prot orf20254:77573-76680:e 894 bp, 297 aa (S>0); Yip1 (PF04893, Yip1 domain)

Hypothetical Proteins/Unknown Function

orf19.206.prot orf10045:20903-24049:e 3147 bp, 1048 aa
orf19.207.prot orf10045:26578-30792:e 4215 bp, 1404 aa
orf19.301.prot orf10046:120011-117750:e 2262 bp, 753 aa
orf19.535.prot orf10053:120118-119783:e 336 bp, 111 aa
orf19.876.prot orf10076:188089-187349:e 741 bp, 246 aa
orf19.893.prot orf10076:211831-210158:e 1674 bp, 557 aa
orf19.968.prot orf10080:112221-111826:e 396 bp, 131 aa
orf19.1401.prot orf10113:88168-86207:e 1962 bp, 653 aa
orf19.1714.prot orf10123:230778-231701:e 924 bp, 307 aa
orf19.1824.prot orf10131:16317-15382:e 936 bp, 311 aa
orf19.1911.prot orf10136:5219-6373:e 1155 bp, 384 aa
orf19.2451.prot orf10150:39779-38391:e 1389 bp, 462 aa
orf19.2475.prot orf10150:86806-87201:e 396 bp, 131 aa
orf19.2683.prot orf10158:49768-50091:e 324 bp, 107 aa
orf19.2765.prot orf10158:213017-212376:e 642 bp, 213 aa
orf19.2767.prot orf10158:222188-222529:e 342 bp, 113 aa
orf19.2833.prot orf10161:53883-53290:e 594 bp, 197 aa
orf19.2878.prot orf10162:21056-20559:e 498 bp, 165 aa
orf19.2906.prot orf10162:84421-85311:e 891 bp, 296 aa
orf19.2907.prot orf10162:86265-86948:e 684 bp, 227 aa
orf19.3638.prot orf10184:95571-96593:e 1023 bp, 340 aa
orf19.3738.prot orf10190:38823-38314:e 510 bp, 169 aa
orf19.3740.prot orf10190:40096-39248:e 849 bp, 282 aa
orf19.3923.prot orf10194:48400-47774:e 627 bp, 208 aa
orf19.3989.prot orf10194:179619-179128:e 492 bp, 163 aa
orf19.4334.prot orf10202:203858-203136:e 723 bp, 240 aa
orf19.4404.prot orf10204:7868-5664:e 2205 bp, 734 aa
orf19.4651.prot orf10212:172267-171848:e 420 bp, 139 aa
orf19.4652.prot orf10212:175815-175504:e 312 bp, 103 aa
orf19.4653.prot orf10212:177244-176915:e 330 bp, 109 aa
orf19.4654.prot orf10212:178442-178113:e 330 bp, 109 aa
orf19.5144.prot orf10219:44069-43389:e 681 bp, 226 aa
orf19.5303.prot orf10225:26690-27523:e 834 bp, 277 aa
orf19.5305.prot orf10225:30293-30907:e 615 bp, 204 aa
orf19.5588.prot orf10230:139710-142007:e 2298 bp, 765 aa
orf19.5760.prot orf10233:120390-119212:e 1179 bp, 392 aa
orf19.5762.prot orf10233:123429-122758:e 672 bp, 223 aa
orf19.6302.prot orf10244:97-942:en 846 bp, 281 aa
orf19.6321.prot orf2413:1868-1542:e 327 bp, 108 aa
orf19.6390.prot orf10247:33937-33635:e 303 bp, 100 aa
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Last modified: 4th September 2003