IMP GPI Lipid Anchor Project IMP-Bioinformatics

GPI-modification site prediction in non-annotated sequences
SPTREMBL rel.9 (Jan 1999) : Protozoa

Contact:
Birgit Eisenhaber (IMP/Austria)
Peer Bork (MDC/EMBL)
Frank Eisenhaber (IMP/Austria)

How to read the prediction results

# SPTREMBL rel.9 (Jan 1999)  PROTOZOA  
# sptrembl/inv.dat 88 (3337)
ID: Q26804	AC: Q26804 Len:  510 1:A   487 Sc:   30.91 Pv: 2.348052e-03 2:N   488 Sc:   -9.13 Pv: 1.831014e-02
ID: O15742	AC: O15742 Len:  632 1:B   606 Sc:   18.04 Pv: 4.551229e-03 2:B   610 Sc:   16.66 Pv: 4.884999e-03
ID: Q26036	AC: Q26036 Len:   68 1:B    45 Sc:   28.73 Pv: 2.626474e-03 2:S    46 Sc:   -4.20 Pv: 1.423739e-02
ID: Q26763	AC: Q26763 Len:   59 1:B    36 Sc:   29.67 Pv: 2.502380e-03 2:S    38 Sc:   -6.18 Pv: 1.575253e-02
ID: Q27069	AC: Q27069 Len:  111 1:B    94 Sc:   19.16 Pv: 4.296814e-03 2:S    93 Sc:   -4.90 Pv: 1.475707e-02
ID: Q94772	AC: Q94772 Len:  274 1:B   257 Sc:   22.25 Pv: 3.664377e-03 2:S   256 Sc:   -4.22 Pv: 1.425224e-02
ID: P90594	AC: P90594 Len:  470 1:B   447 Sc:   27.84 Pv: 2.748872e-03 2:N   449 Sc:   -9.61 Pv: 1.876837e-02
ID: Q26807	AC: Q26807 Len:  409 1:B   387 Sc:   16.35 Pv: 4.962788e-03 2:N   386 Sc:  -12.05 Pv: 2.125219e-02
ID: Q26836	AC: Q26836 Len:  490 1:B   467 Sc:   27.10 Pv: 2.855325e-03 2:D   469 Sc:    4.77 Pv: 8.991241e-03
ID: Q26839	AC: Q26839 Len:  517 1:B   495 Sc:   24.25 Pv: 3.306131e-03 2:S   494 Sc:   -3.00 Pv: 1.338674e-02
ID: Q26809	AC: Q26809 Len:  512 1:B   489 Sc:   29.48 Pv: 2.526518e-03 2:S   491 Sc:   -5.47 Pv: 1.518865e-02
ID: Q26810	AC: Q26810 Len:  513 1:B   490 Sc:   28.93 Pv: 2.599202e-03 2:S   492 Sc:    1.56 Pv: 1.059817e-02
ID: Q25273	AC: Q25273 Len:  599 1:B   574 Sc:   23.59 Pv: 3.420513e-03 2:D   573 Sc:    2.98 Pv: 9.855890e-03
ID: Q25275	AC: Q25275 Len:  598 1:B   573 Sc:   23.59 Pv: 3.420513e-03 2:D   572 Sc:    2.98 Pv: 9.855890e-03
ID: Q25276	AC: Q25276 Len:  599 1:B   574 Sc:   23.59 Pv: 3.420513e-03 2:D   573 Sc:    2.98 Pv: 9.855890e-03
ID: Q26811	AC: Q26811 Len:  508 1:B   485 Sc:   21.68 Pv: 3.772896e-03 2:S   487 Sc:   -5.92 Pv: 1.554469e-02
ID: Q26808	AC: Q26808 Len:  512 1:B   489 Sc:   29.48 Pv: 2.526518e-03 2:S   491 Sc:   -5.47 Pv: 1.518865e-02
ID: O76979	AC: O76979 Len:  480 1:B   463 Sc:   21.28 Pv: 3.852240e-03 2:S   462 Sc:   -6.40 Pv: 1.592792e-02
ID: Q26823	AC: Q26823 Len:  498 1:C   481 Sc:   11.97 Pv: 6.213567e-03 2:S   480 Sc:    2.21 Pv: 1.025347e-02
ID: Q27008	AC: Q27008 Len:  385 1:C   364 Sc:    8.61 Pv: 7.383930e-03 2:D   362 Sc:    7.48 Pv: 7.825877e-03
ID: O61153	AC: O61153 Len:  296 1:C   270 Sc:   13.98 Pv: 5.604428e-03 2:S   272 Sc:   -5.56 Pv: 1.525827e-02
ID: Q27673	AC: Q27673 Len:  597 1:C   573 Sc:    9.27 Pv: 7.138900e-03 2:D   574 Sc:    6.00 Pv: 8.443295e-03
ID: O15867	AC: O15867 Len:  264 1:C   238 Sc:   10.69 Pv: 6.638128e-03 2:S   240 Sc:   -7.02 Pv: 1.644442e-02
ID: O15868	AC: O15868 Len:  264 1:C   238 Sc:   10.69 Pv: 6.638128e-03 2:S   240 Sc:   -7.02 Pv: 1.644442e-02
ID: O46311	AC: O46311 Len:  589 1:C   563 Sc:   14.76 Pv: 5.385803e-03 2:S   562 Sc:    1.79 Pv: 1.047695e-02
ID: O46312	AC: O46312 Len:  589 1:C   563 Sc:   14.76 Pv: 5.385803e-03 2:S   562 Sc:    1.79 Pv: 1.047695e-02
ID: Q25863	AC: Q25863 Len:  256 1:C   230 Sc:   10.69 Pv: 6.637870e-03 2:S   232 Sc:   -6.70 Pv: 1.617935e-02
ID: Q26840	AC: Q26840 Len:  524 1:C   503 Sc:   11.71 Pv: 6.300025e-03 2:N   502 Sc:  -15.29 Pv: 2.506801e-02
ID: Q25286	AC: Q25286 Len:  591 1:C   565 Sc:   14.76 Pv: 5.385803e-03 2:S   564 Sc:    1.79 Pv: 1.047695e-02
ID: Q25287	AC: Q25287 Len:  590 1:C   564 Sc:   14.76 Pv: 5.385803e-03 2:S   563 Sc:    1.79 Pv: 1.047695e-02
ID: Q25300	AC: Q25300 Len:  136 1:D   117 Sc:    7.88 Pv: 7.666632e-03 2:N   118 Sc:  -32.37 Pv: 5.934725e-02
ID: Q26757	AC: Q26757 Len:  274 1:D   257 Sc:    5.99 Pv: 8.448622e-03 2:N   258 Sc:  -14.18 Pv: 2.369213e-02
ID: Q26827	AC: Q26827 Len:  274 1:D   257 Sc:    5.99 Pv: 8.448622e-03 2:N   258 Sc:  -14.18 Pv: 2.369213e-02
ID: Q26981	AC: Q26981 Len:  462 1:D   445 Sc:    5.41 Pv: 8.702676e-03 2:S   444 Sc:   -3.30 Pv: 1.359819e-02
ID: Q26983	AC: Q26983 Len:  146 1:D   129 Sc:    5.41 Pv: 8.702676e-03 2:S   128 Sc:   -3.30 Pv: 1.359819e-02
ID: Q27221	AC: Q27221 Len:   55 1:D    38 Sc:    6.27 Pv: 8.326018e-03 2:S    37 Sc:   -3.02 Pv: 1.339875e-02
ID: Q25671	AC: Q25671 Len:  122 1:D   101 Sc:    4.37 Pv: 9.180229e-03 2:N   102 Sc:  -24.70 Pv: 4.037929e-02
ID: Q26984	AC: Q26984 Len:  462 1:D   445 Sc:    5.41 Pv: 8.702676e-03 2:S   444 Sc:   -3.30 Pv: 1.359819e-02
ID: Q99356	AC: Q99356 Len:  145 1:D   123 Sc:    5.97 Pv: 8.454771e-03 2:N   125 Sc:  -17.06 Pv: 2.741776e-02
ID: O00786	AC: O00786 Len:  264 1:D   238 Sc:    3.23 Pv: 9.730358e-03 2:N   240 Sc:  -23.42 Pv: 3.784474e-02
ID: O00787	AC: O00787 Len:  264 1:D   238 Sc:    3.23 Pv: 9.730358e-03 2:N   240 Sc:  -23.42 Pv: 3.784474e-02
ID: O00788	AC: O00788 Len:  264 1:D   238 Sc:    3.23 Pv: 9.730358e-03 2:N   240 Sc:  -23.42 Pv: 3.784474e-02
ID: O00789	AC: O00789 Len:  264 1:D   238 Sc:    3.23 Pv: 9.730358e-03 2:N   240 Sc:  -23.42 Pv: 3.784474e-02
ID: O00790	AC: O00790 Len:  264 1:D   238 Sc:    3.23 Pv: 9.730358e-03 2:N   240 Sc:  -23.42 Pv: 3.784474e-02
ID: Q25664	AC: Q25664 Len:  122 1:D   101 Sc:    4.37 Pv: 9.180229e-03 2:N   102 Sc:  -24.70 Pv: 4.037929e-02
ID: Q25669	AC: Q25669 Len:  122 1:D   101 Sc:    5.45 Pv: 8.685968e-03 2:N   102 Sc:  -24.70 Pv: 4.037591e-02
ID: Q25670	AC: Q25670 Len:  122 1:D   101 Sc:    5.45 Pv: 8.685968e-03 2:N   102 Sc:  -24.70 Pv: 4.037591e-02
ID: Q25685	AC: Q25685 Len: 1785 1:D  1764 Sc:    5.45 Pv: 8.685968e-03 2:N  1765 Sc:  -24.70 Pv: 4.037591e-02
ID: Q25954	AC: Q25954 Len:  287 1:D   261 Sc:    2.88 Pv: 9.907820e-03 2:S   263 Sc:   -5.91 Pv: 1.553832e-02
ID: Q26713	AC: Q26713 Len:  479 1:D   456 Sc:    4.08 Pv: 9.315297e-03 2:N   457 Sc:  -23.19 Pv: 3.741003e-02
ID: Q25668	AC: Q25668 Len: 1766 1:D  1745 Sc:    4.37 Pv: 9.180229e-03 2:N  1746 Sc:  -24.70 Pv: 4.037929e-02
ID: Q25862	AC: Q25862 Len:  278 1:D   252 Sc:    2.88 Pv: 9.907820e-03 2:S   254 Sc:   -5.91 Pv: 1.553832e-02
ID: Q25950	AC: Q25950 Len:  262 1:D   236 Sc:    2.88 Pv: 9.907820e-03 2:S   238 Sc:   -5.91 Pv: 1.553832e-02
ID: Q08772	AC: Q08772 Len:  468 1:D   445 Sc:    3.32 Pv: 9.686792e-03 2:N   451 Sc:   -9.34 Pv: 1.850723e-02
ID: O76421	AC: O76421 Len:  479 1:D   456 Sc:    4.08 Pv: 9.315297e-03 2:N   457 Sc:  -23.19 Pv: 3.741003e-02
ID: O77209	AC: O77209 Len:  786 1:D   763 Sc:    4.45 Pv: 9.139679e-03 2:S   762 Sc:   -8.11 Pv: 1.738140e-02
ID: O15774	AC: O15774 Len:  122 1:S    96 Sc:   -2.84 Pv: 1.327953e-02 2:N   100 Sc:  -18.32 Pv: 2.923068e-02
ID: P90612	AC: P90612 Len:  172 1:S   153 Sc:   -7.06 Pv: 1.647436e-02 2:N   154 Sc:  -18.43 Pv: 2.938995e-02
ID: O60946	AC: O60946 Len:  261 1:S   239 Sc:   -1.56 Pv: 1.243979e-02 2:N   240 Sc:  -13.16 Pv: 2.248550e-02
ID: O61045	AC: O61045 Len:  207 1:S   181 Sc:   -3.99 Pv: 1.408221e-02 2:N   182 Sc:  -18.83 Pv: 2.999458e-02
ID: Q26037	AC: Q26037 Len:   56 1:S    38 Sc:    1.86 Pv: 1.043854e-02 2:S    37 Sc:   -7.78 Pv: 1.709681e-02
ID: Q99047	AC: Q99047 Len:  320 1:S   302 Sc:   -7.76 Pv: 1.707478e-02 2:N   301 Sc:  -23.62 Pv: 3.823583e-02
ID: Q99048	AC: Q99048 Len:  296 1:S   278 Sc:   -7.85 Pv: 1.715681e-02 2:N   277 Sc:  -16.26 Pv: 2.632475e-02
ID: Q03625	AC: Q03625 Len:  767 1:S   744 Sc:   -0.06 Pv: 1.151469e-02 2:N   746 Sc:  -14.28 Pv: 2.380426e-02
ID: Q07419	AC: Q07419 Len:  256 1:S   229 Sc:   -0.22 Pv: 1.161362e-02 2:S   226 Sc:   -5.73 Pv: 1.539705e-02
ID: Q07592	AC: Q07592 Len:  194 1:S   177 Sc:    1.57 Pv: 1.059529e-02 2:N   176 Sc:   -8.61 Pv: 1.783122e-02
ID: Q94563	AC: Q94563 Len:  170 1:S   153 Sc:    1.57 Pv: 1.059529e-02 2:N   152 Sc:   -8.61 Pv: 1.783122e-02
ID: O61144	AC: O61144 Len:  429 1:S   407 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   406 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61145	AC: O61145 Len:  421 1:S   399 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   398 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61146	AC: O61146 Len:  425 1:S   403 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   402 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61147	AC: O61147 Len:  425 1:S   403 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   402 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61148	AC: O61148 Len:  429 1:S   407 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   406 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61149	AC: O61149 Len:  421 1:S   399 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   398 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61150	AC: O61150 Len:  429 1:S   407 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   406 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61151	AC: O61151 Len:  425 1:S   403 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   402 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: O61152	AC: O61152 Len:  433 1:S   411 Sc:   -6.34 Pv: 1.588115e-02 2:N   412 Sc:  -22.76 Pv: 3.659657e-02
ID: O62597	AC: O62597 Len:  429 1:S   407 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   406 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: Q25331	AC: Q25331 Len:  385 1:S   358 Sc:   -5.46 Pv: 1.518245e-02 2:N   368 Sc:  -13.01 Pv: 2.231470e-02
ID: O15828	AC: O15828 Len:  417 1:S   398 Sc:    2.62 Pv: 1.004212e-02 2:S   399 Sc:    1.50 Pv: 1.063046e-02
ID: Q26124	AC: Q26124 Len:  393 1:S   371 Sc:   -6.01 Pv: 1.561745e-02 2:N   369 Sc:  -24.55 Pv: 4.007496e-02
ID: Q25648	AC: Q25648 Len:  272 1:S   250 Sc:   -6.37 Pv: 1.590318e-02 2:N   249 Sc:  -27.49 Pv: 4.645483e-02
ID: Q25339	AC: Q25339 Len:  384 1:S   357 Sc:   -5.46 Pv: 1.518245e-02 2:N   367 Sc:  -13.01 Pv: 2.231470e-02
ID: Q26062	AC: Q26062 Len:  441 1:S   419 Sc:   -6.74 Pv: 1.621211e-02 2:N   418 Sc:  -24.06 Pv: 3.908459e-02
ID: Q25649	AC: Q25649 Len:  332 1:S   310 Sc:   -6.37 Pv: 1.590318e-02 2:N   309 Sc:  -27.49 Pv: 4.645483e-02
ID: Q03752	AC: Q03752 Len:  416 1:S   394 Sc:   -6.37 Pv: 1.590318e-02 2:N   393 Sc:  -27.49 Pv: 4.645483e-02
ID: Q26110	AC: Q26110 Len:  393 1:S   371 Sc:   -6.01 Pv: 1.561745e-02 2:N   369 Sc:  -24.55 Pv: 4.007496e-02
ID: O76980	AC: O76980 Len:  454 1:S   438 Sc:   -2.12 Pv: 1.279996e-02 2:N   431 Sc:  -16.03 Pv: 2.602349e-02
ID: Q23871	AC: Q23871 Len:  254 1:S   236 Sc:   -3.91 Pv: 1.402456e-02 2:N   233 Sc:  -16.96 Pv: 2.728398e-02


Last modified: 13th June 2002